MAPCGA芯片

MAPCGA芯片

一款专为中国人群定制的全基因组SNP芯片

M A P CG A 是 首 款 依 托 于 上 万 例 中 国 人 群 高 深 度 全 基 因 组 测 序 数 据 所 设 计 的 芯 片，也 是 一 款包 含 约 7 6 万 变 异 位 点 的 全 基 因 组 S N P 芯 片 。该 芯 片 约 有 4 千 个 药 物 基 因 组 相 关 位 点 、3 0 多 万个功能性位点及12万个与欧美血统频率差异位点 。通过基因型填补，MAPCGA可覆盖96%的中 国 人 群 变 异 位 点，更 适 用 于 中 国 人 群 的 医 学 研 究 。M A P CG A 涵 盖 疾 病、免 疫、群 体 特 异、药物代谢、营养代谢等领域的相关位点，可广泛应用于疾病学术研究及健康管理，助力中国健康事业的研究发展。

站点信息

●基因骨架位点（468k）：>1万例40x平均深度的全基因组测序数据。

芯片优势

特异性强

MAPCGA依托于目前最大规模的中国人群全基因组测序项目ChinaMAP，是专为中国人群定制的全基因组SNP芯片。

覆盖率高

多达76万个位点，基因型填补后，是目前市场上中国人群常见变异位点覆盖率最高的芯片。

分别基于ChinaMAP、1KGP reference panel参考位点集合计算基因型填补情况；使用两组高深度 (>30x) 全基因组测序样品集：

填补性全

MAPCGA在多个模拟数据集上均表现出最好的基因型填补效能。

应用面广

芯片关注与疾病密切相关以及功能相关的SNP，囊括药物基因组相关位点和中国人群特异性位点，可更好的 应用于药物基因组代谢、群体遗传等多方面研究 。

应用领域